Zapalenie migdałków podniebiennych leczy się zwykle za pomocą antybiotyków, które zwalczają infekcję bakteryjną. Lekarz może przepisać antybiotyk doustny, który powinien być przyjmowany przez określony czas. By leczenie było skuteczne, należy pamiętać, aby brać przepisane dawki i nie przerywać kuracji, nawet jeśli objawy ustąpią. Dodatkowo przyjmowany jest często paracetamol lub ibuprofen, które pomagają złagodzić ból i obniżają gorączkę. Wskazane jest również ssanie pastylek do gardła.