Leczenie zakażeń dolnych dróg oddechowych zależy od przyczyny i nasilenia objawów. Najczęściej stosowane są antybiotyki do walki z infekcjami bakteryjnymi. Dobór antybiotyku zależy od rodzaju bakterii, które wywołały infekcję. Ważne jest przyjmowanie antybiotyków zgodnie z zaleceniami lekarza, nawet jeśli objawy ustąpią, aby zapobiec ponownemu zakażeniu. W przypadku infekcji wirusowych leki przeciwwirusowe mogą być pomocne, ale często stosuje się leczenie objawowe, jak np. leki przeciwkaszlowe, nawilżacze powietrza czy odpoczynek.