Zaburzenia przemiany glikoprotein powodują różne objawy, które zależą od specyficznego typu zaburzenia. Mogą zawierać problemy z poruszaniem się, rozmową lub nauką, słabość mięśni, przewlekłe bóle brzucha, biegunkę lub zaparcia, zmiany w wyglądzie fizycznym oraz nieprawidłowości w narządach wewnętrznych, jak wątroba czy serce.